Берое 2006 започна с равенство пролетния полусезон в Зоналната група при децата. Момчетата на Боян Стоянов завършиха 1:1 с Черноморец в среща от 16-я кръг на шампионата. Попадението за Берое бе дело на Георги Чорбаджийски. "Зелено-белите" обаче направиха куп пропуски по време на целия двубой, които ги лишиха от успеха. В следващия кръг Берое 2006 гостува на Сливен 2000.